Please use this identifier to cite or link to this item:
http://repository.ipb.ac.id/handle/123456789/98645| Title: | DNA Barcode Trigona terminata, T. drescheri, T. moorei dan T. thoracica berdasarkan Gen cytochrome oxidase 1 (CO1). |
| Other Titles: | DNA Barcode of Trigona terminata, T. moorei, T. drescheri and T. thoracica based on Cytochrome oxidase 1 (CO1) gene |
| Authors: | Sayusti, Tiara |
| Issue Date: | 2015 |
| Publisher: | Bogor Agricultural University (IPB) |
| Abstract: | Lebah Trigona (Apidae: Meliponinae) yang termasuk ke dalam stingless bees memiliki keanekaragaman yang tinggi di daerah tropis. DNA Barcode adalah teknik identifikasi molekuler yang mendukung identifikasi morfologi berdasarkan sekuen DNA yang telah distandarisasi, pada hewan menggunakan gen cytochrome oxidase 1 (CO1) dari genom mitokondria (mtDNA). Sedikitnya database DNA Barcode Trigona membuat penelitian ini sangat penting untuk dilakukan. Penelitian ini bertujuan menganalisis sekuen gen CO1 Trigona terminata, T. drescheri, T. moorei dan T. thoracica. Empat spesies Trigona yang digunakan dalam penelitian ini berasal dari hutan karet dan desa Batu kucing, Jambi. Sekuen gen CO1 yang telah didapat dilakukan analisis bioinformatik serta konstruksi pohon filogeni menggunakan metode Maximum Parsimony. Penelitian ini menghasilkan parsial sekuen gen CO1 dari empat spesies Trigona dengan panjang sekuen berkisar antara 740-761 bp. Hasil analisis bioinformatik terhadap keempat sekuen tersebut menunjukan nilai homologi dan query cover mencapai 100 % serta e-value yang rendah. Pohon filogeni menunjukkan bahwa T. drescheri, T. laeviceps, T. terminata, T. moorei, dan T. thoracica tergabung ke dalam satu kelompok dengan nilai bootstrap 98 %. Selain itu, berdasarkan gen CO1 diketahui bahwa T. drescheri merupakan spesies terdekat dari T. laeviceps yang mendukung data morfologi yaitu kedua spesies Trigona tersebut berada dalam satu subgenus Tetragonula. |
| URI: | http://repository.ipb.ac.id/handle/123456789/98645 |
| Appears in Collections: | UT - Biology |
Files in This Item:
| File | Size | Format | |
|---|---|---|---|
| G15tsa.pdf Restricted Access | 10.81 MB | Adobe PDF | View/Open |
Items in DSpace are protected by copyright, with all rights reserved, unless otherwise indicated.