Analisis Interaksi Protein-Protein dengan Menggunakan Skyline Query pada Penyakit Parkinson

Abstract

Protein signifikan merupakan protein penting yang diperlukan tubuh untuk pertumbuhan. Gangguan fungsional pada protein ini dapat menyebabkan penyakit atau kerusakan organ tubuh tertentu. Salah satu penyakit yang cepat pertumbuhannya adalah Parkinson. Protein dalam menjalankan fungsinya berinteraksi satu sama lain. Dari interaksi antar protein ini dapat dibentuk suatu jejaring interaksi. Centrality measures dapat digunakan untuk mencari protein yang paling berpengaruh di dalam jejaring interaksi sesuai kriteria kebaikan centrality measures yang digunakan. Skyline Query merupakan algoritme untuk mencari data tidak terdominasi yang akan memberikan hasil optimal untuk permasalahan dengan berbagai kriteria. Hasil pencarian Skyline Query dengan menggunakan enam atribut centrality measures yang digunakan menghasilkan 14 protein signifikan. Analisis terhadap protein yang dihasilkan menunjukan bahwa dari 14 protein yang dihasilkan, 12 protein di antaranya telah terbukti memiliki pengaruh terhadap Parkinson. Adapun 12 protein tersebut adalah PARK2, SNCA, ATP13A2, TP53, MAPT, FYN, HSF1, DRD2, VEGFA, AKT1, MPO, dan SLC18A2.