Ekspresi Gen Penyandi Pathogenesis Related Protein (PR1&PBZ1) pada Padi Indica yang terlibat dalam Sistem Toleransi terhadap Blas Isolat 001

Abstract

Penyakit blas yang disebabkan oleh patogen Pyricularia grisea adalah salah satu penyakit penting yang mempengaruhi produksi padi. Gen penyandi Pathogenesis Related protein (PR1 dan PBZ1) diketahui terlibat dalam sistem pertahanan tanaman terhadap cekaman penyakit blas. Penelitian ini bertujuan untuk mempelajari ekspresi gen penyandi pathogenesis related protein (PR1 dan PBZ1) dari tanaman padi indica varietas tahan dan peka yang telah diinfeksi dengan patogen P. grisea isolat 001. Penelitian ini diharapkan memberi informasi mengenai mekanisme sistem pertahanan tanaman padi terhadap penyakit blas sehingga bisa di gunakan sebagai landasan untuk merakit tanaman tahan blas. Penelitian ini dilakukan dalam dua tahap yaitu: Tahap I adalah penapisan ketahanan berbagai varietas padi indica terhadap Pyricularia grisea isolat 001. Tahap II adalah analisis ekspresi gen PBZ1 dan gen PR1. Penapisan pada penelitian ini menggunakan dua isolat yaitu isolat 001M (Muara) dan 001B (BB-Biogen), dengan tetapi hanya 001M yang digunakan untuk penelitian selanjutnya dikarenakan isolat 001M menghasilkan skala penyakit blas menurut standar IRRI yang lebih konsisten/seragam terhadap kelima varietas. Penapisan dilakukan terhadap 5 varietas tanaman padi (Asahan, IR64, Cisadane, Cisanggang dan Kencana Bali). Penapisan dilakukan dengan cara menyuntikkan 1 ml inokulum isolat 001M (3x105 sel/ml) yang diberi tween 20 dengan konsentrasi 0,25% dan 1 ml air yang diberi tween 20 dengan konsentrasi 0,25 % untuk tanaman kontrol. Perlakuan diulang sebanyak 3 kali. Isolasi RNA total diisolasi dari tanaman tahan dan peka pada umur 0, 1, 3 dan 7 hari setelah infeksi. Sintesis cDNA dilakukan dengan menggunakan enzim transkriptase balik Superscript III. Analisis ekspresi untuk gen PR1 dan PBZ1 dilakukan dengan menggunakan metode PCR.