Optimasi Metode Deteksi dan Ekspresi Gen α-Amilase Inhibitor pada Sengon (Falcataria moluccana Miq.)

Abstract

Salah satu permasalahan yang sering terjadi di hutan rakyat maupun hutan tanaman sengon (Falcataria moluccana Miq.) dengan pola penanamannya yang cenderung monokultur adalah serangan hama penggerek batang boktor (Xystrocera festiva Pascoe). Langkah awal pengembangan sengon yang tahan terhadap serangan hama boktor dapat dilakukan dengan cara pendeteksian gen ketahanan terhadap hama boktor dan mengetahui aktivitas gen melalui analisis ekspresi gen. Salah satu gen ketahanan hama boktor pada sengon yaitu α-amilase inhibitor. Penelitian ini bertujuan untuk optimasi metode deteksi dan analisis ekspresi gen α-amilase inhibitor pada sengon. Prosedur kerja dalam penelitian ini meliputi isolasi DNA dan RNA total, uji kualitatif dan kuantitatif DNA dan RNA total, sintesis cDNA, perancangan primer spesifik gen AAI (target) dan aktin (kontrol), optimasi suhu annealing primer gen AAI dan aktin menggunakan template DNA dan cDNA, sekuensing serta optimasi konsentrasi sampel cDNA pada Real Time PCR. Sekuen gen spesifik aktin berhasil diperoleh dari primer TAAct sebesar 121 bp dan menunjukkan kesamaan dengan gen aktin Sarocalamus faberi. Sekuen gen spesifik α-amilase inhibitor diperoleh dari primer GMAAI sebesar 195 bp dan menunjukkan kesamaan dengan gen LTP Rosa chinensis yang mempunyai fungsi dan struktur domain mirip dengan α-amilase inhibitor. Analisis ekspresi gen aktin dan AAI menggunakan primer TAAct dan GMAAI masih perlu dioptimasi lagi.