Deteksi Gen Penyandi Gaharu δ-Guaiene pada Tanaman Aquilaria malaccensis Lamk dan Gyrinops versteegii Domke

Abstract

Produktivitas gaharu sebagai salah satu hasil hutan bukan kayu (HHBK) yang memiliki prospek tinggi untuk dikembangkan di Indonesia semakin menurun. Untuk itu diperlukan bibit gaharu unggul yang dipastikan dapat menghasilkan gaharu dengan kualitas tinggi. Salah satu komponen dominan yang menyebabkan bau khas pada gaharu adalah guaiene. Tujuan penelitian ini adalah mendeteksi gen guaiene dengan beberapa primer spesifik serta optimasi tahapan PCR untuk ekspresi gen guaiene pada dua jenis tanaman yaitu A. malaccensis dan G. versteegii. Metode deteksi gen guaiene meliputi, isolasi DNA dan RNA, perancangan primer spesifik gen guaine, sitensis cDNA, serta PCR dengan primer spesifik tersebut dilanjutkan dengan sekuensing produk PCR. Sekuen gen spesifik guaiene berhasil dideteksi pada DNA dengan ukuran 135 bp pada G. versteegii dan 133 bp pada A. malaccensis yang memiliki kesamaan tertinggi dengan Aquilaria sinensis. Sekuen gen spesifik guaiene berhasil dideteksi pada cDNA dengan ukuran 133bp yang memiliki kesamaan tertinggi dengan A. crassna. Primer yang dapat mendeteksi gen guaiene adalah Am3-δG dengan suhu annealing optimum 56.5 dan 57˚C.