Antibakteri Berbasis Glukosa Oksidase IPBCC.08.610 terhadap Enzim MurA dan Elongation Factor G secara In Silico

Abstract

Antibakteri berbasis enzim merupakan antibakteri alami yang dapat digunakan sebagai pengganti antibakteri sintetis. Penelitian ini bertujuan mempelajari potensi antibakteri glukosa oksidase IPBCC.08.610 dengan melakukan interaksi produk enzim glukosa oksidase IPBCC.08.610 yaitu dengan enzim MurA dan EFG secara in silico. Pendekatan penelitian yang digunakan yaitu homologi dan analisis sisi aktif gen glukosa oksidase IPBCC.08.610 dan penambatan molekuler produk glukosa oksidase IPBCC.08.610 pada enzim MurA dan EFG menggunakan AutoDock Vina dengan parameter keberhasilan berupa nilai %BSS, energi bebas, serta konstanta inhibisi. Hasil penelitian ini, memastikan bahwa urutan gen pada penelitian sebelumnya mengkodekan glukosa oksidase IPBCC.08.610. Glukonolakton dan asam glukonat dapat berinteraksi dengan Cys115 dan Asp305 pada MurA dengan %BSS berturut-turut sebesar 87.5% dan 100%, energi bebas sebesar -5.8 kKal/mol dan -5.4 kKal/mol dengan nilai Ki sebesar 55.443 μM dan 108.988 μM. Glukonolakton berhasil berinteraksi dengan Thr84 dan asam glukonat tidak dapat berinteraksi dengan residu target pada EFG dengan %BSS sebesar 40% dan 20%, energi bebas sebesar -5.3 kKal/mol dan -4.6 kKal/mol dengan nilai Ki sebesar 129.051 μM dan 421.146 μM. Glukosa Oksidase IPBCC.08.610 dapat digunakan sebagai antibakteri dengan menghambat MurA.