Please use this identifier to cite or link to this item:
http://repository.ipb.ac.id/handle/123456789/88814| Title: | . Akurasi Dna Barcode Untuk Identifikasi Jenis Dipterokarpa Langka Di Hutan Harapan Jambi |
| Authors: | Siregar, Iskandar Z Ardiyani, Marlina Handayani, Rajjitha |
| Issue Date: | 2016 |
| Publisher: | Bogor Agricultural University (IPB) |
| Abstract: | Dipterokarpa merupakan salah satu suku yang memiliki lebih dari 500 jenis tersebar di dunia. Beberapa dipterokarpa sulit dibedakan dari bentuk daun dan ukurannya pada tingkat bibit. Hal tersebut mengakibatkan terjadinya kesalahan identifikasi jenis selama pengadaan stok bahan tanaman berasal dari pengumpulan bibit yang tumbuh alami atau cabutan dari lantai hutan. Pada saat ini, lemahnya akurasi proses identifikasi jenis dapat diatasi dengan metode DNA barcode. Metode ini telah teruji berhasil pada banyak kasus yang membutuhkan hasil identifikasi secara cepat dan dapat diandalkan. Tujuan penelitian ini adalah menguji keakuratan DNA barcode menggunakan lokus matK, rbcL dan ITS2 untuk mengidentifikasi jenis dipterokarpa langka yang dikumpulkan dari lapangan (yaitu tingkat bibit). Total sampel yang digunakan dalam analisis sebanyak 20 yang mewakili 5 jenis dipterokarpa langka. Konstruksi pohon filogenetik menggunakan sekuens tambahan dari NCBI GeneBank. Hasil penelitian menunjukkan bahwa lokus matK, rbcL, dan ITS2 berhasil diamplifikasi dan disekuensing, namun tidak membentuk barcode gap berdasarkan jarak intra dan inter-spesifik walaupun ada yang membentuk kelompok monofiletik. Metode identifikasi konvensional menggunakan pengenal pohon dan pencocokan herbarium pada tingkat bibit atau pohon dewasa dalam kondisi steril (tidak memiliki bunga dan buah) menunjukkan tingkat akurasi yang rendah. Metode DNA barcode hanya mampu mengidentifikasi jenis hingga tingkat suku dan marga. Oleh karena itu, identifikasi jenis secara akurat pada bibit atau pohon dewasa yang steril masih menjadi masalah pada dipterokarpa. |
| URI: | http://repository.ipb.ac.id/handle/123456789/88814 |
| Appears in Collections: | MT - Forestry |
Files in This Item:
| File | Size | Format | |
|---|---|---|---|
| 2016rha.pdf Restricted Access | 17.13 MB | Adobe PDF | View/Open |
Items in DSpace are protected by copyright, with all rights reserved, unless otherwise indicated.