Identifikasi Keragaman Gen Calpain (CAPN|RsaI) pada Sapi Pedaging Indonesia Menggunakan Metode PCR-RFLP.

Abstract

Gen Calpain (CAPN) merupakan gen kandidat potensial yang diidentifikasi dapat mempengaruhi keempukan daging. Penelitian ini bertujuan untuk mengidentifikasi keragaman gen Calpain (CAPN|RsaI) pada sapi pedaging Indonesia menggunakan metode PCR-RFLP. Sampel darah diambil dari 110 ekor sapi yang terdiri dari sapi bali, peranakan ongole, dan limousin. Enzim yang digunakan pada penelitian ini adalah RsaI. Analisis data dilakukan dengan menghitung frekuensi alel dan genotipe, keseimbangan Hardy-Weinberg, dan derajat heterozigositas (heterozigositas harapan dan heterozigositas pengamatan). Hasil analisis gen CAPN|RsaI pada sapi bali, peranakan ongole, dan limousin bersifat polimorfik. Frekuensi alel C lebih tinggi dari frekuensi alel T pada semua populasi. Sampel sapi bali berada pada keseimbangan Hardy-Weinberg, sedangkan sampel sapi peranakan ongole dan limousin tidak seimbang (P>0.05). Nilai heterozigositas pengamatan pada ketiga sampel berkisar antara 0.05-0.34 lebih rendah dari 0.50. Keragaman gen CAPN dapat dijadikan sebagai kandidat marker sifat keempukan daging pada sapi bali, peranakan ongole, dan limousin.