Identifikasi Keragaman Gen Apo Very Low Density Lipoprotein-II (ApoVLDL-II|SfcI) pada Ayam Lokal dengan Metode PCR-RFLP.

Abstract

Gen Apo Very Low Density Lipoprotein-II (ApoVLDL-II) adalah gen yang berperan penting dalam transpor lipid. Penelitian ini bertujuan untuk mengidentifikasi keragaman gen ApoVLDL-II pada Ayam Lokal Indonesia dengan menggunakan metode PCR-RFLP dan enzim retriksi SfcI. Sampel yang digunakan sebanyak 199 ekor ayam lokal Indonesia yang terdiri atas 70 ekor ayam kampung ciawi, 56 ekor ayam kampung sukabumi, 25 ekor ayam merawang, 25 ekor ayam sentul, dan 23 ekor ayam pelung. Panjang produk hasil PCR gen ApoVLDL-II adalah 489 pb. Hasil genotyping terdapat 3 genotipe yaitu AA (489 pb), AG (489 pb, 396 dan 93 pb) dan GG (396 pb dan 93 pb). Frekuensi genotipe tertinggi adalah GG. Frekuensi alel G pada semua populasi lebih tinggi daripada frekuensi alel A. Populasi semua ayam lokal berada pada keseimbangan Hardy- Weinberg (X2 hitung < X2 tabel) kecuali ayam kampung ciawi. Nilai heterozigositas harapan (He) ayam kampung ciawi dan sukabumi lebih besar dari nilai heterozigositas pengamatan (Ho), sedangkan ayam merawang, sentul dan pelung sebaliknya. Gen ApoVLDL-II pada ayam lokal Indonesia ditemukan beragam.