Seleksi Dan Studi Pewarisan Serta Pengembangan Marka Ssr Penanda Ketahanan Terhadap Penyakit Layu Bakteri (Ralstonia Solanacearum) Pada Tomat

Abstract

Tomat yang dimanfaatkan dalam bentuk buah segar ataupun olahan merupakan tanaman sayuran buah penting, baik di Indonesia maupun di dunia. Di Indonesia, kebutuhan tomat masih belum terpenuhi oleh produksi dalam negeri sehingga berpengaruh pada harga yang sering berfluktuasi. Beberapa masalah yang mempengaruhi produksi tomat telah diketahui, salah satunya serangan penyakit layu bakteri. Penyakit yang tersebar luas di area tropis dan subtropis ini disebabkan oleh bakteri Ralstonia solanacearum. Bakteri ini bersifat gram negatif dan merupakan bakteri tular tanah. Penelitian ini terdiri dari empat percobaan, yang meliputi : (1) seleksi tiga puluh genotipe tomat lokal koleksi terhadap karakter ketahanan penyakit layu bakteri (Ralstonia solanacearum) yang bertujuan untuk menyeleksi ketahanan genotipe tomat lokal koleksi terhadap penyakit layu bakteri, (2) studi pewarisan karakter ketahanan terhadap penyakit layu bakteri pada tomat yang bertujuan untuk mempelajari pola pewarisan sifat ketahanan terhadap penyakit layu bakteri pada tomat, dan (3) identifikasi marka SSR (Simple Sequence Repeats) penanda ketahanan terhadap penyakit layu bakteri pada tomat yang bertujuan untuk mendapatkan marka SSR penanda ketahanan terhadap penyakit layu bakteri pada tomat. Percobaan pertama dan kedua dilakukan dengan menggunakan isolat bakteri yang berasal dari tanaman sakit di lapang. Tanaman diinokulasi pada saat minggu keempat setelah semai dengan cara pelukaan ujung akar dan direndam pada 20 mL suspensi bakteri selama 30 menit. Kemudian tanaman disiram oleh suspensi bakteri tersebut. Percobaan ketiga dilakukan melalui tiga tahapan, yaitu: seleksi primer dengan menggunakan dua genotipe tahan dan rentan (hasil dari percobaan pertama), BSA pada populasi F2, dan identifikasi ketahanan tomat koleksi dengan menggunakan primer terpilih. Setiap genotipe tomat lokal koleksi menunjukkan ketahanan yang berbeda. Dari tiga puluh genotipe tomat lokal koleksi terdapat 1 genotipe sangat tahan (Kudamati 1), 8 genotipe tahan (Gondol Lonjong, Khemir, Kudamati 3, Lombok 3, Makasar 3, Situbondo Bulat Kecil, Situbondo Gelombang, dan Tanah Datar), 3 genotipe agak tahan (Aceh 1, Aceh 5, dan Bajawa), 8 agak rentan (Cherry NTT, Kali Acai, Kefamenanu 3, Kefamenanu 6, Kefamenanu7, Makasar 1, Makasar 2, dan Makasar 4), 1 rentan (Meranti 1) dan 9 genotipe sangat rentan (Aceh 2, Aceh 3, Kefamenanu 9, Kefamenanu 12, Kefamenanu 14, Lombok 1, Lombok 2, Lombok 4, dan Meranti 2). Genotipe Kudamati 1 dan Lombok 4 digunakan untuk merakit populasi F1, F1R, dan F2 pada Percobaan Kedua. Pengujian pada populasi F1 menunjukkan bahwa pewarisan sifat ketahanan terhadap penyakit layu bakteri pada tomat tidak dipengaruhi efek maternal dan bersifat dominan tidak sempurna. Uji χ2 pada populasi F2 mengarah pada rasio 9:7 (tahan : rentan) yang menandakan bahwa sifat ini merupakan karakter kualitatif yang dikendalikan oleh dua pasang gen mayor dengan aksi gen duplikat resesif epistasis. Tiga tahapan yang dilakukan pada percobaan tiga menunjukkan bahwa primer TOM-144 diduga bersifat polimorfik sebagai penanda ketahanan terhadap penyakit layu bakteri. Hasil pita amplifikasi menunjukkan bahwa genotipe tahan memiliki ukuran yang berkisar pada 144 bp. Primer TOM-144 mampu mengidentifikasi ketahanan tomat terhadap penyakit layu bakteri. Hasil penelitian ini dapat dimanfaatkan oleh para pemulia untuk dapat mengembangkan varietas tahan berupa galur murni ataupun hibrida. Marka SSR yang didapat juga dapat mengidentifikasi secara cepat ketahanan terhadap penyakit layu bakteri pada genotipe atau varietas lainnya.