Ekspresi Gen Penyandi Farnesoic Acid O-Methyl Transferase (Famet) Pada Organ Mandibular Kepiting Scylla Olivacea Fase Intermolt Dan Premolt

Abstract

Farnesoic Acid O-Methyl Transferase (FAmeT) merupakan enzim untuk mengkonversi Asam Farnesoat (AF) menjadi Metil Farnesoat (MF) sebagai salah satu hormon yang berperan dalam proses metamorfosis dan reproduksi pada krustasea. Tujuan penelitian ini adalah untuk mengetahui tingkat ekspresi gen penyandi FAmeT pada fase sebelum molting yaitu intermolt dan premolt serta mengetahui urutan oligonukleotida parsial cDNA penyandi FAmeT kepiting Scylla olivacea. Analisis tingkat ekspresi gen dilakukan dengan melakukan ekstraksi RNA organ mandibular kepiting bakau pada masing-masing fase dan dilanjutkan dengan reverse transcription polymerase chain reaction (RT-PCR). Produk PCR diukur konsentrasinya dengan spektrofotometer dan pendaran RNA pada gel diukur ketebalannya dengan software UN-SCAN IT. Produk PCR yang dihasilkan kemudian dipurifikasi dan dilakukan pengurutan oligonukleotida. Hasil pengurutan oligonukleotida digunakan untuk mengetahui tingkat kesamaan urutan oligonukleotida cDNA penyandi FAmeT Scylla olivacea dengan urutan oligonukleotida cDNA penyandi FameT Scylla serrata, Scylla paramamosain dan Portunus. Hasil penelitian menunjukan bahwa konsentrasi produk PCR cDNA penyandi FAmeT pada organ mandibular kepiting fase premolt lebih tinggi dibanding pada fase intermolt walaupun perbedaannya tidak begitu signifikan. Hasil kuantifikasi konsentrasi produk PCR cDNA penyandi FAmeT menggunakan spektrofotometer menunjukkan rata-rata konsentrasi produk PCR pada fase intermolt adalah 765.4 ng/μl ±9.2, sementara pada fase premolt adalah 790.3 ng/μl ±15.1. Nilai rata-rata hasil kuantifikasi konsentrasi ekspresi berdasarkan ketebalan pendaran pita cDNA penyandi FAmeT pada gel adalah 412.1 ng/μl ±143.3 pada fase intermolt dan fase premolt adalah 442.5 ng/μl ±137.2. Hasil pengurutan oligonukleotida cDNA penyandi FAmeT Scylla olivacea menunjukkan urutan oligonukleotida yang hampir identik dengan 2 jenis Scylla lainnya yaitu Scylla serrata dan Scylla paramamosain yang sebelumnya telah dilaporkan dan didaftarkan di GenBank.