Variasi geografik dalam struktur genetik populasi ikan Kakap merah, Lutjanus malabaricus (Lutjanidae) dan interaksi lingkungan di Laut Jawa

Abstract

Penelitian tentang variasi geografik dalam struktur genetik populasi ikan Kakap merah (Lutjanus malabaricus, LUTJANIDAEd)a n interaksinya dengan kondisi perairan Laut Jawa berdasarkan karakter polimorfisme yang terdapat pada region control mtDNA (D-loop) dan kajian tentang kondisi lingkungan perairan Laut Jawa. Penelitian bertujuan untuk menentukan unit-unit stok ikan yang dieksploitasi guna keperluan pengelolaan perikanannya secara tepat di wilayah ini. Karakter polimorfisme diperoleh dari analisis RFLP (Restriction Fragment Length Polymorphism) terhadap sekuen yang teramplifikasi dengan menggunakan tiga jenis enzym restriksi (Alu I, Nla III dan Xba I). Genom mtDNA'diekstrak dari daging ikan contoh yang dikumpdkan di lapangan dan mewakili lima populasi ikan di Laut Jawa, yaitu populasi Blanakan, Batang, Banyutowo, Tuban dan Kotabaru. Amplifikasi genom dilakukan melalui proses PCR (Polymerase Chain Reaction) dengan menggunakan primer spesifik TDKD & PRO.