Single Nucleotide Polymorphism of Prolactin Gene Exon Two in Ducks of Pekin, Mojosari and Pekin Mojosari Crossbred

Abstract

Gen prolaktin merupakan gen kandidat yang memerankan fungsi krusial pada reproduksi dan produksi telur pada unggas. Tujuan penelitian ini adalah mengidentifikasi polimorfisme gen prolaktin itik pada ekson dua dan parsial intron. Sampel darah berasal dari 168 itik yang terdiri dari 19 ekor Pekin, 36 ekor Mojosari dan 113 ekor silangan Pekin Mojosari yang dikoleksi dari Balai Penelitian Ternak Ciawi. Primer ekson dua didesain berdasarkan database prolaktin itik (Kode Akses GenBank: AB158611.1). Amplifikasi menghasilkan produk PCR dengan ukuran sekitar 400 pb. Ditemukan satu insersi basa Adenin pada posisi basa 2001 pada daerah intron dua. Hasil uji homologi dengan metode BLAST memiliki tingkat kesamaan 99% dengan database acuan (Kode Akses GenBank: AB158611.1). Komposisi Adenin pada keseluruhan sampel lebih tinggi dibandingkan database prolaktin acuan. Ikatan triplet hidrogen pada pasangan basa Adenin-Timin lebih tinggi dibandingkan ikatan duplet pada pasangan basa Guanin-Sitosin. Semua sampel itik pada penelitian ini homozigot dan monomorfik.