Identifikasi Keragaman Genetik Klon Karet dengan Teknik Amplified Fragment Length Polymorphism (AFLP).

Abstract

Tanaman karet di Indonesia telah banyak dikembangkan dalam bentuk klonklon unggul. Proses pemuliaan dengan mengidentifikasi keragaman genetik secara molekuler, salah satunya dengan teknik AFLP, memiliki tingkat polimorfisme dan pengulangan yang tinggi. Tujuan penelitian ini adalah untuk mengidentifikasi keragaman genetik klon karet. Sebanyak 3 klon karet, IRR 104, RRIM 600, dan PR 300 masing-masing diisolasi DNA genomnya, kemudian direstriksi menggunakan dua enzim restriksi, diligasikan terhadap adapter, dilakukan preamplifikasi dan diamplifikasi menggunakan 64 kombinasi pasangan primer serta analisis hasil elektroforesis dari elektroferogram gel poliakrilamid 6 %. Sebanyak 1023 pita AFLP telah dihasilkan. Keseluruhan pita polimorfis diubah menjadi dendrogram dengan kesamaan genetik ketiganya sebesar 29 %. Selanjutnya garis dendrogram terpisah menjadi dua kelompok, kelompok 1 terdiri dari klon IRR 104 dan RRIM 600 dengan kesamaan genetik sebesar 43 %. Kelompok 2 yang hanya terdiri dari klon PR 300. Informasi dendrogram yang diperoleh telah menunjukkan keragaman genetik ketiga klon karet yang bersifat polimorfis.