Keragaman Gen Prolaktin Ekson Empat pada Itik Peking, Itik Mojosari Putih dan Itik PMp serta Asosiasinya dengan Sifat Reproduksi

Abstract

Prolaktin merupakan hormon polipeptida yang disekresikan oleh kelenjar pituitary anterior dan memiliki berbagai dampak terhadap aktifitas dan fungsi biologis semua hewan bertulang belakang (vertebrata). Tujuan dari penelitian ini adalah untuk menganalisis polimorfisme wilayah gen prolaktin ekson empat dan sebagian intron 3 dan 4 serta mengasosiasikan polimorfisme gen tersebut dengan sifat-sifat reproduksi itik. Ekstraksi yang dilakukan pada sampel darah menggunakan Genomic DNA Mini Kit (GeneAidTM DNA Isolation Kit) dimana sampel darah diperoleh dari 168 itik yang terdiri dari 19 ekor itik Peking, 36 ekor itik Mojosari putih dan 113 ekor itik silangan Peking Mojosari putih. Sepasang primer ekson 4 disusun berdasarkan database sekuens genom yang telah terpublikasi di Genbank dengan kode akses AB158611. Analisis pensejajaran terhadap sekuens DNA didapat enam SNP yang terdiri dari dua mutasi transversi yaitu T3941G dan C3975A, satu mutasi transisi yaitu T4110C, dua delesi basa adenin pada posisi pada posisi 3724 pb (INDEL 3724A) dan 4031 pb (INDEL 4031A) dan insersi pada posisi 3939 pb (INDEL 3939A). Khusus untuk INDEL 3939A terjadi pada semua sampel itik penelitian. Hasil analisis frekuensi alel menunjukan bahwa pada titik mutasi INDEL 3724A, T3941G, C3975A, INDEL 4031A dan T4110A pada itik sampel adalah polimorfik karena terdapat dua alel yang berbeda dengan frekuensi alel < 99%. Lain halnya dengan titik mutasi INDEL 3939A dimana hanya ditemukan satu jenis alel dengan hasil perhitungan frekuensi alel sebesar 100% dengan kata lain bahwa dalam populasi itik sampel INDEL 3939A adalah monomorfik. Analisis statistik chi square mengenai perbedaan SNP terhadap jenis itik yang berbeda menunjukan bahwa tidak ada hubungan antara perbedaan jenis SNP yang ditemukan dengan ketiga jenis itik Peking, Mojosari putih dan PMp, sedangkan analisis asosiasi SNP terhadap sifat-sifat reproduksi itik dapat menunjukan bahwa lima titik mutasi yang ditemukan pada sekuens gen prolaktin yaitu INDEL 3724A, T3941G, C3975A, INDEL 4031A dan T4110C berpengaruh secara signifikan terhadap sifat produksi telur, persentase fertilitas dan daya tetas telur itik.