Identifikasi Isolat RK2 BPPT CC dan Isolasi Gen Selulase

Abstract

Selulase adalah enzim ekstraseluler yang dapat diproduksi oleh mikroorganisme. Enzim ini dapat menghidrolisis selulosa untuk menghasilkan glukosa. Tujuan penelitian ini adalah mengidentifikasi isolat RK2 BPPT CC dan mengisolasi gen selulase dari isolat tersebut. Identifikasi isolat RK2 BPPT CC dilakukan menggunakan urutan basa gen penyandi 16S-rRNA. Isolasi gen selulase dilakukan dengan metode Polymerase Chain Reaction (PCR) touchdown menggunakan primer yang telah didesain. Primer yang didesain adalah primer degenerated hasil alignment dari berbagai gen selulase yang berasal dari bakteri yang bergenus sama. Analisis gen 16S-rRNA isolat RK2 BPPT CC menunjukkan bahwa isolat RK2 BPPT CC termasuk ke dalam genus Bacillus dan memiliki kekerabatan yang dekat dengan Bacillus amyloliquefaciens (B. amyloliquefaciens). Isolasi gen selulase menghasilkan produk PCR yang spesifik sepanjang 1500 bp yang diduga sebagai gen selulase. Analisis sekuen nukleotida menunjukkan bahwa gen selulase isolat RK2 BPPT CC memiliki 99% kemiripan sekuensnya dengan gen selulase dari Bacillus subtilis (B. subtilis) dan B. amyloliquefaciens.