Diferensiasi DNA Mitokondria Lebah Madu Apis cerana di Jawa, Lombok, Sumbawa dan Flores

Abstract

Indonesia memiliki biodiversitas spesies lebah madu tertinggi, lima dari sembilan spesies lebah di dunia, termasuk lebah Apis Cerana. Namun disayangkan belum ada data distribusi dan genetik lebah A. Cerana di Indonesia. Tujuan penelitian adalah mengeksplorasi distribusi peternak lebah A. cerana di Jawa, Lombok, Sumbawa dan Flores dan mempelajari diferensiasi DNA mitokondria lebah dengan menggunakan penanda genetik daerah intergenik coxI_II dan gen ribosom besar (IrRNA). Penelitian menggunakan analisis: (1) keragaman genetik, (2) gen penenda, (3) metode sekuen nukleotida, (4) statistik nukleotida dan (5) homologi nukleotida. Di Jawa berhasil dikoleksi 113 koloni A. cerana. Daerah intergenik coxI_II/DraI yang dianalisis menghasilkan tujuh haplotipe yaitu haplotipe A, B, C, D, E, F dan G. Haplotipe A dari gen coxI_II/DraI merupakan haplotipe umum di Jawa dan Lombok, dengan prosentase 28 % di Jawa dan 15% di Lombok. Haplotipe D prosentase tinggi di Jawa (timur) sebesar 31,77%, sedang di Lombok (4,95%) dan sumbawa (0,9%). Haplotipe F ditemukan di Sumbawa dengan prosentase rendah (0,93%). Haplotipe G dengan presentase sedang di Sumbawa dan Flores masing-masing 2,8% dan 3,73%. Daerah gen IrRNA yang dipotong dengan DraI menghasilkan haplotipe A dan B di Jawa. Haplotipe C ditemukan di Lombok, Sumbawa dan Flores. Haplotipe A dari gen IrRNA/DraI merupakan haplotipe umum di seluruh daerah koleksi di Jawa, Lombok, Sumbawa dan Flores. Haplotipe A gen IrRNA/DraI merupakan haplotipe dominan (90,29%) pada populasi A. cerana di ketiga lokasi. Keragaman genetik lebah A. cerana sangat tinggi di Jawa, Lombok, Sumbawa dan Flores dan terdapat haplotipe-haplotipe yang khas dari beberapa pulau yang dapat menjadi penanda atau marker dari tiap subpopulasi di pulau-pulau.