Please use this identifier to cite or link to this item:
http://repository.ipb.ac.id/handle/123456789/46516
Full metadata record
DC Field | Value | Language |
---|---|---|
dc.contributor.advisor | Suastika, Gede | |
dc.contributor.author | Andriani, Amelia | |
dc.date.accessioned | 2011-06-30T07:23:13Z | |
dc.date.available | 2011-06-30T07:23:13Z | |
dc.date.issued | 2011 | |
dc.identifier.uri | http://repository.ipb.ac.id/handle/123456789/46516 | |
dc.description.abstract | Tanaman tomat (Lycopersicon esculentum Mill.) merupakan salah satu komoditas hortikultura yang sangat potensial untuk dikembangkan. Namun, upaya peningkatan produksi dan mutu tomat untuk memenuhi kebutuhan nasional dan ekspor menghadapi banyak kendala, salah satunya adalah gangguan organisme pengganggu tumbuhan (OPT). Beberapa tahun terakhir ini terdapat penyakit baru yang menyerang tanaman tomat yang disebabkan oleh Tomato chlorosis virus (ToCV) dan Tomato infectious chlorosis virus (TICV). Penyakit yang diinduksi oleh ToCV maupun TICV tidak dapat dibedakan gejalanya. Penelitian ini bertujuan untuk mendapatkan metode deteksi diferensial TICV dan ToCV melalui reverse transcription polymerase chain reaction (RT-PCR). Sampel tanaman tomat yang positif terinfeksi tunggal oleh ToCV maupun TICV, dan yang positif terinfeksi ganda oleh TICV dan ToCV diperoleh dari hasil penelitian terdahulu. Untuk menguji penerapan metode RT-PCR terhadap sampel dari lapangan, beberapa sampel juga diperoleh dari sentra produksi tomat di beberapa daerah seperti Cianjur, Cipanas, Lembang, dan Garut. Sampel daun yang diambil dari lapangan di ekstraksi dan dideteksi dengan metode RT-PCR dan PCR, kemudian hasil PCR dielektroforesis. Untuk dapat membedakan virus ToCV dan TICV yang menginfeksi tanaman tomat, deteksi dilakukan dengan menggunakan primer khusus, yaitu ToCV-CF (5’GTGTCAGGCCATTGTAAACCAAG-3’) ToCV-CR (5’CACAAAGCGTTTCTTTTCATAAGCAGG-3’), TICV-CF (5’AATCGGTAG TGACACGAGTAGCATC-3’) dan TICV-CR (5’-CTTCAAACATCCTCCATCT GCC-3’) yang dapat mengamplifikasi virus secara terpisah. Hasil penelitian ini menunjukkan bahwa pasangan primer ToCV dan TICV benar-benar spesifik hanya mendeteksi virusnya masing-masing. Panjang pita produk RT-PCR untuk ToCV diperoleh 360 bp, sedangkan untuk TICV adalah 417 bp. Kedua pasang primer untuk ToCV dan TICV yang dicampur dapat digunakan untuk mendeteksi kedua virus ini, baik yang menginfeksi tunggal maupun bersama-sama dalam jaringan tanaman tomat. Selain utuk mendeteksi virus, metode RT-PCR dengan kedua pasang primer ini juga dapat diterapkan untuk diagnosis. | en |
dc.publisher | IPB (Bogor Agricultural University) | |
dc.subject | Tomato chlorosis virus (ToCV) | en |
dc.subject | Tomato infectious chlorosis virus (TICV) | en |
dc.subject | RT-PCR | en |
dc.title | Deteksi diferensial Tomato chlorosis virus (ToCV) dan Tomato infectious chlorosis virus (TICV) dengan reverse transcription-polymerase chain reaction (RT-PCR) | en |
Appears in Collections: | UT - Plant Protection |
Files in This Item:
File | Description | Size | Format | |
---|---|---|---|---|
A11aan.pdf Restricted Access | Full text | 1.07 MB | Adobe PDF | View/Open |
A11aan_Cover.pdf Restricted Access | Cover | 290.52 kB | Adobe PDF | View/Open |
A11aan-2_Abstract.pdf Restricted Access | Abstract | 271.88 kB | Adobe PDF | View/Open |
A11aan_BAB I Pendahuluan.pdf Restricted Access | BAB I | 276.84 kB | Adobe PDF | View/Open |
A11aan_BAB II Tinjauan Pustaka.pdf Restricted Access | BAB II | 475.1 kB | Adobe PDF | View/Open |
A11aan_BAB III Bahan dan Metode.pdf Restricted Access | BAB III | 286.75 kB | Adobe PDF | View/Open |
A11aan_BAB IV Hasil dan Pembahasan.pdf Restricted Access | BAB IV | 789.72 kB | Adobe PDF | View/Open |
A11aan_Kesimpulan.pdf Restricted Access | Kesimpulan | 272.73 kB | Adobe PDF | View/Open |
A11aan_Daftar Pustaka.pdf Restricted Access | Daftar Pustaka | 297.09 kB | Adobe PDF | View/Open |
Items in DSpace are protected by copyright, with all rights reserved, unless otherwise indicated.