Analisis molekuler fragmen gen penyandi hemaglutinin virus avian influenza subtipe H5N1 dari unggas air

Abstract

Sumber penularan virus avian influenza (VAI) subtipe H5N1 pada unggas dan manusia di Indonesia belum diketahui secara jelas. Penelitian ini bertujuan untuk (1) mengisolasi VAI subtipe H5N1 dari unggas air (itik, entok, angsa) di peternakan skala rumah tangga (backyard) di Jawa Barat terutama di Kabupaten Sukabumi dan Bogor; (2) menentukan patotipe virus-virus tersebut berdasarkan marka molekuler gen penyandi sekuen asam amino daerah pemotongan (cleavage site) fragmen gen hemaglutinin (HA); (3) menganalisis domain-domain penting gen penyandi HA virus AI subtipe H5N1 isolat unggas air; (4) menganalisis filogenetik fragmen HA1 dari gen HA virus AI subtipe H5N1 yang diisolasi dari unggas air dengan representasi virus asal hewan dan manusia Indonesia dan beberapa negara Asia; (5) mengetahui reaksi silang virus tersebut dengan strain virus standar Indonesia.