Keanekaragaman dan Sebaran Zooplankton Famili Pontellidae (Kopepoda Kalanoida) Berdasarkan DNA lingkungan dan Morfologi di Perairan Pesisir Indonesia

Abstract

Zooplankton Famili Pontellidae merupakan kelompok kopepoda yang menghuni lapisan permukaan pelagis atas di perairan pesisir. Masuknya kontaminan dari daratan ke kolom perairan lapisan atas berpotensi mempengaruhi kehidupan zooplankton termasuk kopepoda Pontellidae. Dampak aktivitas antropogenik terhadap keanekaragaman dan kelimpahan zooplankton (kopepoda Pontellidae) belum diketahui. Studi pada skala perairan yang luas terkait zooplankton (kopepoda) masih sangat terbatas karena hambatan dalam memperoleh sampel pada wilayah perairan Indonesia. Penelitian ini bertujuan untuk: (1) menganalisis perkembangan riset zooplankton di perairan Indonesia; (2) menganalisis keanekaragaman dan sebaran zooplankton metabarkoding di Perairan Pesisir Indonesia; (3) menganalisis keanekaragaman dan sebaran kopepoda Pontellidae di perairan pesisir di Indonesia; (4) menganalisis spesies baru kopepoda Pontellidae grup Pontella alata (5) menganalisis integrasi pendekatan DNA lingkungan dan karakter morfologi dalam mengungkap keanekaragaman kopepoda Pontellidae di perairan pesisir Indonesia. Hasil kajian menunjukkan bahwa terjadi perubahan perkembangan topik penelitian zooplankton dari taksonomi kopepoda menjadi plankton ekologi. Pendekatan yang komprehensif menggunakan karakter morfologi dan genetika diharapkan mampu mengatasi permasalahan riset zooplankton di Indonesia. Keanekaragaman zooplankton metabarkoding yang teridentifikasi sebanyak 97 spesies. Keanekaragaman alfa zooplankton di perairan Teluk sikka tertinggi pada tingkat spesies. Tingginya keanekaragaman zooplankton metabarkoding di Teluk Sikka menunjukkan kondisi perairan dan ekosistem yang baik serta rendahnya aktivitas antropogenik. Kelimpahan relatif zooplankton metabarkoding tertinggi di Teluk Jakarta. DNA lingkungan dengan primer 18s metabarkoding dapat mendeteksi taksa zooplankton dalam rentang yang luas. Keanekaragaman dan sebaran kopepoda Pontellidae di perairan pesisir Teluk Sikka paling tinggi diantara lokasi penelitian yang lain. Analisis karakter morfologi mampu mendeteksi jenis kelamin individu jantan dan betina serta stadia perkembangan hidup kopepoda. Deskripsi spesies baru kopepoda Pontellidae Pontella mayalibit n.sp dari perairan Teluk Mayalibit, Raja Ampat. Pendekatan DNA lingkungan dapat mendeteksi dan mengidentifikasi zooplankton tetapi mempunyai keterbatasan dalam mendeskripsi pada tingkat spesies. Metode eDNA bersifat tidak merusak biota target. Integrasi DNA lingkungan dan karakter morfologi mampu mengungkap keanekaragaman zooplankton (kopepoda) dengan jangkauan yang lebih luas. Sehingga meningkatkan keberhasilan dalam memahami keanekaragaman zooplankton di perairan pesisir.