Analisis Ukuran Kromosom dan Pola Restriksi Bacillus thuringiensis dengan Elektroforesis Medan Berpulsa

Abstract

Bacillus thuringiensis (BT) merupakan salah satu bakteri yang bermanfaat bagi kehidupan manusia. B. thuringiensis memiliki keistimewaan mensintesis protein 8-endotoksin yang spesifik terhadap serangga tertentu dan beberapa neraatoda perusak sehingga sering digunakan sebagai pestisida alami. Laboratorium Biologi Mikroba, LIPI, memiliki beberapa koleksi bakteri BT lokal yang diharapkan merupakan subspesies baru. Penelitian ini diharapkan dapat memberikan studi awal dari galur-galur lokal BT di daerah sekitar Bogor dan juga untuk memastikan kemungkinan adanya subspesies baru, maka dilakukan uji genotipe dengan menggunakan Elektroforesis Gel Medan Berpulsa. Hasil penelitian menunjukkan secara umum B. thuringiensis memiliki resistensi terhadap antibiotik ampisilin. Isolasi DNA berhasil dilakukan dan dibuktikan dengar elektroforesis. Metode isolasi DNA yang paling cocok untuk PFGE adalah metode plug yang dikembangkan oleh Cantor. Analisis pita restriksi tidak dapat dilakukan dengan baik karena proses restriksi enzim tidak memberikan pita yang jelas tapi justru memberikan pita smear. Perkiraan genom total sementara untuk galur standar berada pada 1800-2500 kbp sedangkan untuk galur lokal berada pada 1100 2600 kbp. Perhitungan genom total secara nyata dan perkiraan kekerabatan antar galur lokal tidak berhasil dilakukan.