Karakterisasi Morfologi dan Molekuler Famili Arcidae Berdasarkan Tipologi Habitat Perairan Pesisir Banten

Abstract

Bivalvia (kekerangan) memiliki nilai ekonomis dan ekologis penting di perairan Banten. Aktivitas konsumsi hasil perikanan tersebut meningkat dan dapat menyebabkan kelangkaan spesies. Oleh karena itu, untuk mempertahankan keaslian spesies perlu dikaji secara detail karakter morfologi hingga molekuler dari spesies tersebut. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui karakter morfologi dan molekuler famili Arcidae yang berasal dari Teluk Lada dan Teluk Naga berdasarkan marka molekuler Cytochrome Oxidase Subunit I (COI). Isolasi dan ekstraksi menghasilkan tiga DNA total yang kemudian diamplifikasi dengan PCR, sekuensing gen COI, dan dihasilkan nukleotida dengan panjang masing-masing 369, 459, dan 617 pb. Gen COI dari spesies yang diamati disejajarkan dengan beberapa gen COI spesies lain, yaitu ingroup dan outgroup dari famili Arcidae yang didapatkan dari GenBank. Pensejajaran dilakukan dengan menggunakan software MEGA 5.0. Konstruksi pohon filogeni memperlihatkan perbedaan yang jelas antara spesies dari famili Arcidae dengan famili non-Arcidae. Perbedaan habitat dapat menimbulkan karakter spesifik dari organisme.