Identifiksi Keragaman Gen Mioglobin dan Asosiasinya dengan Kandungan Mineral Daging Ayam Cemani dan Ayam IPB-D

Abstract

Gen mioglobin (MB) adalah gen yang mengkodekan protein mioglobin. Protein mioglobin bekerja pada jaringan otot yang berperan sebagai tempat penyimpanan oksigen dan memfasilitasi difusi oksigen. Mineral mikronutrien seperti Fe, Zn, Mn, dan Se yang memiliki peran dalam metabolisme oksigen dan antioksidan pada tubuh. Daging ayam yang konsumsinya terus meningkat tiap tahunnya dapat dijadikan potensi untuk mengembangkan pangan alternatif yang mengandung mineral esensial karena harga daging ayam yang lebih terjangkau dibandingkan dengan harga daging merah. Penelitian bertujuan meganalisis keragaman gen MB pada ayam cemani dan ayam IPB-D serta asosiasinya dengan kandungan mineral Fe, Zn, Mn, dan Se pada daging ayam. Sebanyak 104 sampel yang berasal dari 6 populasi: ayam cemani Balitnak (16), ayam cemani SUI (17), ayam IPB-D1 (5), ayam IPB-D2 (25), ayam IPB-D3 (38), dan ayam broiler (3) digunakan dalam penelitian ini. Keragaman gen MB dianalisis menggunakan metode direct-sequensing. Analisis kandungan mineral menggunakan metode AAS. Daging ayam yang dianalisis mineralnya menggunakan daging ayam bagian paha atas dan paha bawah. Informasi keragaman yang digunakan adalah frekuensi alel, frekuensi genotipe, heterozigositas dan keseimbangan Hardy-Weinberg. General Linear Model digunakan dalam menganalisis asosiasi kandungan mineral dengan keragaman gen MB. Hasil penelitian ditemukan 2 SNP gen MB yaitu g.17 G>T dan g.25 T>C. SNP g.17 G>T bersifat monomorfik kecuali pada sampel ayam IPB-D yang bersifat polimorfik. SNP g.25 C>T bersifat polimorfik pada ayam IPB-D dan ayam SUI, sedangkan ayam cemani Balitnak dan broiler bersifat monomorfik. Kandungan mineral tertinggi untuk Fe terdapat pada sampel ayam cemani Balitnak, sedangkan kandungan tertinggi mineral Zn terdapat pada ayam IPB-D1, dan kandungan mineral Mn serta Se paling tinggi terdapat di ayam cemani SUI. Kandungan mineral Fe berasosiasi dengan keragaman ayam IPB-D2 SNP g.17 G>T, dan mineral Mn, Zn, dan Se berasosiasi dengan keragaman pada ayam IPB-D3 SNP g.17 G>T dan SNP g.25 T>C.