Validasi Kura-kura Brazil Trachemys scripta elegans (Wied-Nuwied, 1839) yang Diperdagangkan Di Bogor Berdasarkan Marka Gen Cytochrome Oxydase Subunit I (COI)

Abstract

Kura-kura Brazil Trachemys scripta elegans (Wied-Nuwied, 1839), termasuk hewan introduksi semi akuatik di Indonesia. Namun, keberadaannya dikhawatirkan dapat mengancam spesies lokal akibat pelepasliaran di perairan bebas. Tujuan penelitian ini adalah untuk validasi secara molekuler spesies kura-kura Brazil (Trachemys scripta elegans) di wilayah Bogor, Jawa Barat yang didasarkan pada marka gen COI. Metode yang digunakan meliputi isolasi dan ekstraksi DNA, elektroforesis, amplifikasi, serta sekuensing. Analisis data berupa analisis morfologi, pensejajaran nukleotida, validasi fragmen COI, perhitungan jarak genetik, konstruksi pohon filogenetik, dan keragaman haplotype. Hasil didapat berupa 11 DNA target yang memiliki jarak genetik < 3% dengan Trachemys scripta elegans, hubungan kekerabatan yang dekat dengan Trachemys scripta elegans, serta keragaman haplotype yang sedang. Dapat disimpulkan bahwa sampel berpotensi menjadi invasif jika dilepasliarkan secara bebas dan tervalidasi dengan Trachemys scripta elegans berdasarkan identifikasi molekuler.