Studi Metode Penelitian secara Molekuler Nucleopolyhedrovirus (NPV)

Abstract

Nucleopolyhedrovirus (NPV) merupakan entomovirus dari kelompok Baculovirus yang bekerja spesifik terhadap inang. Saat ini, NPV telah digunakan sebagai bioinsektisida dalam bidang pertanian. Berbagai penelitian dilakukan seperti deteksi, amplifikasi, analisis genetik, transkriptomik, proteomik, dan rekombinasi genetik untuk mempelajari mekanisme virus menyerang inangnya dan meningkatkan patogenesitas serta kisaran inang NPV. Kajian pustaka ini bertujuan memberikan rincian informasi mengenai jenis penelitian NPV secara molekuler beserta metode yang digunakan. Kajian pustaka ini dilakukan dengan menelaah berbagai jurnal mengenai penelitian NPV secara molekuler dan metode-metode yang digunakan. Polymerase Chain Reaction (PCR) merupakan metode umum yang digunakan dalam perbanyakan DNA untuk kemudian digunakan dalam penelitian lebih lanjut secara molekuler. Selain itu, berbagai metode telah dikembangkan dan diaplikasikan dalam penelitian NPV secara molekuler. Analisis fungsi genetik memberikan informasi mengenai fungsi suatu gen yang untuk selanjutnya dapat digunakan dalam modifikasi genetik untuk meningkatkan kinerja NPV. Rekombinasi genetik untuk meningkatkan kinerja NPV juga telah dilakukan seperti penyisipan satu atau beberapa gen ke dalam genom NPV lain untuk memperluas kisaran inang dan meningkatkan patogenesitas virus. Analisis transkriptomik dan proteomik dapat dilakukan untuk mengetahui mekanisme virus menyerang sel inang dan mekanisme sel inang untuk menghalangi infeksi lebih lanjut oleh NPV.

Nucleopolyhedrovirus (NPV) is an entomovirus of the Baculovirus group that works specifically against the host. Currently, NPV has been used as a bioinsecticide in agriculture. Various studies were conducted, such as detection, amplification, genetic analysis, transcriptomics, proteomics, and genetic recombination to study the mechanisms of viruses attacking their hosts and increase the pathogenicity and range of NPV hosts. This literature study aims to provide detailed information about the type of molecular NPV research along with the methods used. The literature study was conducted by studying various journals on molecular NPV research and the methods used. Polymerase Chain Reaction (PCR) is a standard method used in DNA multiplication for later use in further molecular research. In addition, various methods have been developed and applied in molecular NPV research. Genetic function analysis provides information on the function of a gene which can then be used in genetic modification to improve NPV performance. Genetic recombination to improve NPV performance has also been carried out, such as insertion of one or more genes into the genome of another NPV to expand the host range and increase viral pathogenicity. Transcriptomic and proteomic analysis can be performed to determine the mechanism of the virus attacking the host cell and the mechanism of the host cell to prevent further infection by NPV.