Analisis Perubahan Sekuen Nukleotida Gen Squalene Synthase pada Artemisia annua L. Turunan T1 Hasil Induksi Sistem CRISPR

Abstract

Artemisinin yang terkandung dalam Artemisia annua L. dapat digunakan sebagai anti-malaria. Kadar artemisinin pada A. annua L. cukup rendah, yaitu berkisar 0.1% hingga 1%. Peningkatan kadar artemisinin dapat dilakukan dengan menghambat squalene synthase yang merupakan enzim kunci dalam biosintesis sterol menggunakan sistem Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats (CRISPR). Penelitian ini bertujuan untuk melakukan analisis perubahan sekuen nukleotida gen squalene synthase pada A. annua L. yang sudah diinduksi sistem CRISPR. Analisis Perubahan Sekuen Nukleotida Gen Squalene Synthase dilakukan melalui tahap seleksi benih, isolasi DNA menggunakan Tiangen Kit, amplifikasi DNA dengan PCR, dan sekuensing gen squalene synthase. Hasil penelitian menunjukkan dari 9 sampel tanaman A. annua L. hasil induksi sistem CRISPR tidak semua sampel mengalami perubahan basa nukleotida pada situs target. Perubahan sekuen pada situs target hanya terjadi pada sampel 5 yakni perubahan dari A (Adenin) menjadi T (Timin) dan G (Guanin) menjadi C (Sitosin) yang dapat disebut sebagai substitusi transversi. Sampel lainnya yang disejajarkan dengan nontransgenik menunjukkan perubahan sekuen di luar situs target.