Asosiasi Keragaman Gen NRAMP-1 dan iNOS terhadap Newcastle Disease dan Salmonella enteritidis pada Ayam Sentul Seleksi

Abstract

Gen NRAMP-1 dan iNOS telah ditunjukkan sebagai mekanisme pertahanan terhadap infeksi bakteri dan virus. Gen-gen ini belum diselidiki pada ayam Sentul Seleksi. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui keragaman dan asosiasi gen NRAMP-1 dan iNOS sebagai gen kandidat yang berperan dalam resistensi terhadap Newcastle Disease dan Salmonella enteritidis pada ayam Sentul Seleksi. Sejumlah 172 ayam yang dipilih sentul diamati untuk gen NRAMP-1 dan iNOS menggunakan PCR-RFLP. Frekuensi genotipe dan alel, Polymorphic Information Content (PIC), dan keseimbangan Hardy-Weinberg (HWE) telah dianalisis. Genotipe diasosiasikan dengan Immunoglobulin Y (IgY), antibodi spesifik Salmonella dan antibodi spesifik penyakit Newcastle Disease. Parameter ini ditentukan dengan menggunakan indirect ELISA, clearence test and haemagglutination inhibition. Karakteristik kekebalan selanjutnya dikelompokkan menjadi: kategori tinggi, sedang dan rendah. Data dianalisis menggunakan GLM (General Liniear Model) dengan software SAS 9.4, t-test dan chi-square. Keragaman dalam NRAMP-1|SacI dan iNOS|AluI semua telah diamati. Populasi dalam HWE untuk kedua gen. Frekuensi gen NRAMP-1 dan iNOS memiliki genotipe TC yang lebih tinggi secara signifikan (P <0,05) pada ayam dengan imunitas yang tinggi. Selain itu, untuk gen NRAMP-1 dan iNOS, frekuensi alel C lebih tinggi daripada alel T dalam titer IgY tinggi. NRAMP-1|SacI dan iNOS|AluI adalah penanda potensial untuk seleksi terhadap penyakit Newcastle Disease dan Salmonella enteritidis pada ayam Sentul Seleksi. Namun, penyelidikan lebih lanjut direkomendasikan untuk memperkuat rekomendasi ini.