Deteksi dan Identifikasi Cucurbit aphid-borne yellows polerovirus (CABYV) pada Cucurbitaceae di Jawa

Abstract

Cucurbitaceae merupakan salah satu komoditas penting di berbagai dunia. Namun, banyak faktor yang membatasi produksinya, seperti infeksi virus. Tujuan penelitian ini adalah mendeteksi dan mengidentifikasi Cucurbit aphid-borne yellows polerovirus (CABYV) pada Cucurbitaceae di Jawa. Gejala yang mengindikasikan adanya infeksi Polerovirus berupa daun menguning dibatasi pertulangan daun yang berwarna hijau dan ukuran daun tua tidak berubah. Total daun bergejala sekitar 600 sampel dikoleksi dari Jawa Barat (Subang dan Bogor), Jawa Tengah (Brebes, Purworejo, dan Kulonprogo), dan Jawa Timur (Nganjuk, Kediri, dan Tulungagung). Frekuensi infeksi virus-virus yang terdapat pada sampel bergejala ditentukan melalui metode Dot immunobinding assay (DIBA) dengan menggunakan 6 antiserum spesifik. Deteksi asam nukleat menggunakan metode Reverse-Transcription Polymerase Chain Reaction (RT-PCR) dan perunutan DNA menggunakan primer spesifik CABYV. Hasil DIBA menunjukkan sampel yang diuji memberikan hasil positif terhadap Cucurbit aphid-borne yellows virus (CABYV) dengan frekuensi berkisar 22.67-83.33%, Cucumber mosaic virus (CMV) berkisar 2-88.89%, Papaya ringspot virus (PRSV) berkisar 0-87.5%, Tobacco mosaic virus (TMV) berkisar 0-89.6%, Squash mosaic virus (SqMV) berkisar 0-39.7%, dan Zucchini yellow mosaic virus (ZYMV) berkisar 3.9-61.11%. RT-PCR berhasil mengamplifikasi DNA berukuran ± 489 pb dan terkonfirmasi sebagai CABYV pada melon asal Nganjuk dan peria asal Bogor. CABYV isolat melon memiliki homologi tertinggi sebesar 100% dengan isolat mentimun asal Tulungagung, sedangkan isolat peria memiliki homologi tertinggi sebesar 96% dengan isolat melon asal Perancis dan labu asal Spanyol. Tulisan ini merupakan laporan pertama mengenai infeksi CABYV pada melon dan peria di Jawa.