Integrasi Data Protein-Protein Interactions (PPIs) dan Pathway untuk Menentukan Score pada Pathway

Abstract

Perkembangan teknologi biologi molekuler menghasilkan omics data dalam jumlah besar. Integrasi omics data bermanfaat untuk analisis proses biologi pada level molekuler, seperti ekspresi protein, mekanisme obat terhadap penyakit, dan mekanisme pewarisan sifat. Penelitian ini bertujuan mengintegrasikan data biologi molekuler mengenai protein-protein interactions (PPIs), pathway, module dan orthology, dan perhitungan score pada pathway. Integrasi data dilakukan dengan akuisisi dan menghubungkan data satu sama lain. Perhitungan score pada pathway menggunakan perhitungan degree untuk menentukan pathway dominan, karena sederhana dalam penerapannya. Hasil penelitian berupa package untuk integrasi data biologi molekuler dan menghitung score pada pathway. Hasil perhitungan score pathway dengan masukan protein Insulin dan Xanthine dehydrogenase menghasilkan lima pathway dominan, yaitu MAPK signaling pathway, Pathways in cancer, Ubiquitin mediated proteolysis, Purine metabolism dan Metabolic pathways.