Keragaman Nukleotida Ruas Ekson 8 Gen Branched Chain Ketoacid Dehydrogenase E1-α Polypeptide (BCKDHA) pada Sapi Madura

Abstract

Sapi madura termasuk ke dalam jenis sapi lokal Indonesia. Sapi madura merupakan hasil persilangan antara sapi zebu berpunuk (Bos indicus) dengan banteng (B. javanicus). Branched Chain α-ketoacid Dehydrogenase (BCKD) merupakan kompleks enzim terikat membran bagian dalam mitokondria yang berfungsi mengkatalisis dekarboksilasi oksidatif asam amino bercabang menjadi α-keto. Mutasi pada subunit-subunit penyusunnya berpeluang menyebabkan penurunan efisiensi kerja enzim tersebut. Subunit E1-α merupakan salah satu penyusun BCKD yang disandikan oleh gen BCKDHA. Penelitian ini dilakukan untuk menganalisis keragaman nukleotida ruas ekson 8 gen BCKDHA pada sapi madura. Analisis dilakukan terhadap sepuluh sampel sapi madura, satu sampel sapi bali, dan satu sampel sapi peranakan ongole (po). Perunutan dilakukan dengan metode sequencing big dye terminator. Variasi ditemukan pada tujuh dari dua belas sampel DNA yang diteliti. Variasi basa nukleotida sitosin (C) dengan timin (T) pada posisi ke-19093 di ekson 8 menyebabkan perubahan asam amino arginin (R) menjadi sistein (C).