Keragaman Nukleotida Ruas Ekson 1 Gen Branched Chain Ketoacid Dehydrogenase E1-α Polypeptide (BCKDHA) pada Sapi Madura

Abstract

Sapi madura merupakan salah satu bangsa sapi lokal yang memiliki keunggulan berupa kekuatan fisik dan kemampuan adaptasi yang baik terhadap iklim kering. Kompleks Branched Chain α-Keto Dehydrogenase (BCKD) merupakan enzim terikat membran bagian dalam mitokondria yang berfungsi untuk mengkatalisis katabolisme asam amino bercabang menjadi α-keto. Kompleks enzim BCKD memiliki subunit E1-α yang disandikan oleh gen Branched Chain Ketoacid Dehydrogenase E1-α Polypeptide (BCKDHA). Penelitian ini dilakukan untuk menganalisis keragaman nukleotida ruas ujung 3 promotor dan ekson 1 gen BCKDHA pada sapi madura. Analisis keragaman dilakukan pada 6 sampel sapi madura, 1 sampel sapi peranakan ongole (po), dan 1 sampel sapi bali. Substitusi nukleotida G95A ditemukan pada sapi madura dan menyebabkan perubahan asam amino arginin menjadi glutamin. Keragaman nukleotida T125C pada semua sampel sapi menyebabkan perubahan asam amino fenilalanin menjadi serin. Substitusi nukleotida C42G dan G78T tidak mengubah asam amino yang dihasilkan. Mutasi delesi enam nukleotida, ATGGCG, pada ruas ekson 1 gen BCKDHA ditemukan pada empat sampel sapi madura yang merupakan sapi pedaging. Mutasi delesi tersebut memendekkan dua asam amino di ujung N dari peptida sinyal.