Karakterisasi Morfogenetik Nudibranch dari Beberapa Populasi di Indonesia.

Abstract

Nudibranch memiliki keanekaragaman spesies yang tinggi dengan karakter morfologi yang kompleks dan menantang untuk diidentifikasi ke dalam tingkat spesies. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui spesies nudibranch dengan menggunakan morfologi dan karakteristik molekuler. Rekonstruksi pohon filogenetik menggunakan metode Neighbor-joining dengan model parameter Kimura-2 dan 1000 nilai bootstrap. Jarak genetik within and between spesies juga diamati. Sebanyak 51 sampel jaringan dan 18 spesimen dikumpulkan dari populasi yang berbeda di Indonesia. Berdasarkan 18 spesimen yang dikumpulkan, total lima spesies diidentifikasi berdasarkan karakter morfologi (Chromodoris magnifica, Phyllidia elegans, Phyllidia varicosa, Phyllidia coelestis, Phyllidiella pustulosa). Hasil barcode DNA menggunakan gen Cytochrome Oxidase I (COI) menunjukkan 18 spesies dari 51 sampel dianalisis. Rekonstruksi pohon filogenetik tersebut menunjukkan 18 clade yang termasuk dalam lima famili termasuk tiga spesies kelompok Phyllidiella (Phyllidiella pustulosa, Phyllidiella nigra, Phyllidiella picta), tiga spesies kelompok Phyllidia (Phyllidia elegans, Phyllidia coelestis, Phyllidia varicosa), empat spesies kelompok Chromodoris (Chromodoris magnifica, Chromodoris annae, Chromodoris quadricolor, Chromodoris striatella), dan masing-masing spesies di kelompok Goniobranchus (Goniobranchus geometricus), Elysia (Elysia cf marginata), Plakobranchus (Plakobranchus papua), Glossodoris (Glossodoris rufomarginata), Nembrotha (Nembrotha cristata), Mexichromis (Mexichromis multituberculata), Dorisprismatica (Dorisprismatica atromar), dan Tritonidae (Tritonia sp 2). Studi ini menunjukkan bahwa barcode DNA dapat digunakan untuk mengidentifikasi nudibranch sampai tingkat spesies, dan mempercepat eksplorasi spesies yang akan menjadi sumber informasi dalam mengelola sumber daya dan menjaga stabilitas ekosistem.