Identifikasi Keragaman Gen Stearoyl-CoA Desaturase (SCD|HinfI) pada Ayam Silangan Kampung dan Broiler dengan Teknik PCR-RFLP

Abstract

Gen Stearoyl-CoA Desaturase (SCD) merupakan salah satu gen pengode enzim yang terlibat dalam biosintesis asam lemak. Penelitian ini dilakukan untuk mengidentifikasi keragaman gen SCD pada generasi kedua persilangan kampung-broiler (KBKB) dengan menggunakan metode Polymerase Chain Reaction-Restriction Fragment Length Polymorphism (PCR-RFLP). Sampel DNA yang digunakan untuk identifikasi keragaman sebanyak 100 sampel DNA ayam yang terdiri atas 62 sampel ayam KBKB, 20 sampel DNA ayam broiler dan 18 sampel DNA ayam kampung. Perhitungan genotip, frekuensi alel, nilai heterosigositas, dan keseimbangan Hardy-Weinberg pada penelitian ini dilakukan pada ayam persilangan kampung dan broiler. Gen diamplifikasi pada posisi c.17492542G>C dengan panjang sekuen 407 bp dan dipotong menggunakan enzim restriksi HinfI menghasilkan ; 373 dan 34 bp pada genotip GG; 407, 373 dan 34 bp pada genotip GC, serta 407 pada genotip CC. Frekuensi alel tertinggi ditemukan pada alel G. Genotip GG dan GC lebih banyak ditemukan dibandingkan genotip CC pada populasi ayam KBKB. Hasil identifikasi gen SCD|HinfI menunjukkan bahwa populasi ayam KBKB, ayam broiler dan ayam kampung yang digunakan bersifat polimorfik (beragam) dan berada pada keseimbangan Hardy-Weinberg. SCD merupakan gen kandidat yang potensial mengontrol biosintesis asam lemak ayam.