Ukuran Kemiripan Sweetspot Similarity Pada Temu Kembali Informasi Anotasi Gene Ontology Berbasis Solr
View/ Open
Date
2016Author
Hafiz, Dirman
Herdiyeni, Yeni
Adisantoso, Julio
Metadata
Show full item recordAbstract
Biodiversitas Informatik adalah sebuah upaya membuat sumber informasi
keanekaragaman hayati dalam format digital. Biodiversitas informatik
menggunakan struktur ontologi dalam memetakan pengetahuannya. Gene Ontology
(GO) adalah sebuah ontologi di bidang biologi molekular yang dikembangkan oleh
Gene Ontology Consortium. Gene Ontology memiliki 3 komponen, yaitu molecular
function, biological process, dan cellular component. Dibutuhkan mesin pencari
yang relevan serta mampu mengolah data biodiversitas yang besar. Apache SOLR
merupakan mesin pencari yang dibangun pada Apache Lucene. Uji kemiripan pada
SOLR Sweetspot similarity dapat mengantisipasi masalah perbedaan panjang
anotasi GO dengan melakukan normalisasi panjang dokumen. Normalisasi panjang
dokumen ditentukan berdasarkan perbandingan dari beberapa parameter dan
didapatkan nilai min 51, max 100, dan steepness 0.4 sebagai acuan yang terbaik.
Hasil dari penelitian ini menunjukkan nilai Mean Average Precision dan RPrecision
sweetspot similarity lebih baik dibandingkan dengan classic similarity.
Collections
- UT - Computer Science [2322]