Identifikasi Melastoma sp. Asal Jambi Menggunakan DNA Barcoding matK (Maturase K)

Abstract

Melastoma sp. merupakan tumbuhan liar yang banyak tumbuh di Indonesia dan dapat tumbuh hingga ketinggian 1650 mdpl. Tujuan penelitian ini adalah mengidentifikasi spesies Melastoma sp. asal Jambi menggunakan DNA Barcoding matK. Identifikasi dilakukan dengan isolasi DNA, kemudian DNA diamplifikasi dengan metode PCR dan diurutkan basanya secara forward dan reverse. Primer yang digunakan untuk PCR dan pengurutan basa adalah primer matK-3F dan matK- 3R. Panjang urutan basa gen matK yang diperoleh sekitar 750 pb. Hasil pengurutan basa kemudian dianalisis menggunakan program BLAST-N pada situs NCBI dan disejajarkan menggunakan program ClustalW. Jarak genetik dianalisis menggunakan model Tamura 3-Parameter dengan bootstrap 1000x, diperoleh jarak genetik terkecil adalah 0.000 dan tertinggi adalah 0.032. Hasil identifikasi Melastoma sp. menggunakan barcode DNA matK menunjukkan bahwa sampel A1, A3, A4, A5, dan A6 memiliki kedekatan denganMelastoma saigonense, akan tetapi hasil identifikasi berdasarkan morfologi menunjukkan bahwa sampel A1, A3, A4, A5, dan A6 memiliki kesesuaian ciri dengan Melastoma candidum.