Karakterisasi Ekson dan Intron Gen Defensin 1 pada Apis cerana dan A. dorsata.
View/ Open
Date
2017Author
Alfiyan, Achmad
Raffiudin, Rika
Astuti, Rika Indri
Metadata
Show full item recordAbstract
Gen defensin lebah menyandikan peptida defensin yang berfungsi untuk
mempertahankan tubuh dari bakteri Gram positif dan terdapat dua gen defensin,
yaitu gen defensin 1 dan 2. Penelitian ini bertujuan mengkarakterisasi gen
defensin 1 yang terdiri dari ekson 2, intron dan ekson 3 pada A. cerana dan A.
dorsata asal Indonesia. DNA gen defensin 1 sampel A. cerana dan A. dorsata
diamplifikasi menggunakan primer yang didisain berdasarkan GenBank A.
mellifera. Sekuen DNA dan asam amino deduksi dianalisis secara bioinformatika.
Panjang sekuen DNA gen defensin 1 sampel A. cerana dan A. dorsata yang
didapat berturut-turut sebesar 479 dan 458 pb dan panjang asam amino deduktif
kedua sampel berturut-turut sebesar 66 dan 65 dengan 6 asam amino sistein yang
diduga menyebabkan terbentuknya ikatan α dan β pada peptide sehingga
memungkinkan melisis membran sel bakteri melalui pembentukan pori. Variasi
nukleotida di antara spesies A. cerana asal Indonesia dan Korea hanya terdapat
pada intron 2 sedangkan antara A. dorsata Indonesia dan Malaysia terdapat pada
intron 2 dan ekson 3. Topologi pohon filogeni lebah hasil kontruksi berdasarkan
gen defensin 1 mendukung penelitian sebelumnya yaitu A. cerana dan A. dorsata
berkerabat lebih dekat dengan A. mellifera dibandingkan dengan A. florea.
Collections
- UT - Biology [1976]