Analisis ekspresi gen A36 pada kedelai (Glycine max (L .) Merryl) kultivar slamet yang mendapat berbagai cekaman abiotik

Abstract

Klon cDNA A36 adalah gen penyandi protein regulator pertumbuhan yang berasal dari pustaka cDNA tanaman kedelai kultivar Slamet yang mendapat cekaman pH4+Al 0,6 mM (Yuniati, 2000). Ekspresi gen A36 diuji dengan melakukan hibridisasi northern pada RNA yang diletakkan dengan slot blot pada membran nilon. RNA diisolasi dari ujung akar dan daun pucuk kecambah yang mendapat cekaman pH4, pH4 + Al 0.8 mM, pH4 + Fe, pH4 + Zn, pH4 + Cu dan pH6 + NaCl. RNA yang diisolasi dari kecambah yang mendapat perlakuan pH6 digunakan sebagai kontrol. Pita-pita hasil hibridisasi dipindahkan ke atas film sinar-X menghasilkan signal hibridisasi. Signal hibridisasi tersebut kemudian direkam dalam file digital dengan scanner, dan diukur intensitasnya dengan perangkat lunak komputer Adobe Photoshop. Intensitas signal hibridisasi menunjukkan tingkat ekspresi gen A36. Hasil percobaan membuktikan bahwa klon cDNA A36 merupakan gen yang ekspresinya tidak spesifik diinduksi oleh cekaman Al, tetapi oleh pH4 melalui Al dan Fe. Adapun induksi ekspresi hanya terjadi di akar, tidak di daun pucuk. Cekaman logam Zn dan Cu, serta NaCl tidak mempengaruhi ekspresi gen A36 bila dibandingkan dengan ekspresi gen A36 di akar tanaman kontrol.