Variasi gen cytochrome oxidase i (coi) pada lebah trigona di desa batu kucing dan desa bungku, jambi

Abstract

Lebah trigona merupakan salah satu serangga polinator yang berperan dalam ekosistem. Pendataan keanekaragaman trigona secara morfologi telah dilakukan di indonesia, namun pendataan secara molekular dengan variasi gen cytochrome oxidase i (coi) belum dilakukan. Penelitian ini bertujuan menganalisis kekerabatan antar tiga spesies trigona dan mempelajari variasi gen cytochrome oxidase i (coi) pada lebah trigona di desa batu kucing dan desa bungku, jambi. Jumlah sampel yang dianalisis sebanyak dua individu pada t. Fuscobalteata, t. Laeviceps asal desa batu kucing dan desa bungku, jambi. Primer gen coi di disain berdasarkan melipona bicolor dari genbank. Hasil sekuen gen coi trigona secara parsial menghasilkan panjang nukleotida t. Fuscobalteata dan t. Laeviceps berturut-turut sebesar 724 dan 908 pb dengan komposisi at yang tinggi. Alignment sekuen asam amino t. Fuscobalteata, t. Laeviceps dan t. Chanchamayoensis dengan outgroup melipona bicolor menunjukkan daerah yang conserve sebanyak 161 pb dan variasi ditemukan pada 19 pb. Analisis jarak genetik tertinggi diperoleh antara m. Bicolor dengan t. Laeviceps sebesar 0.023. Konstruksi filogeni dilakukan menggunakan metode maximum parsimony (mp) dan neighbour joining (nj). Hasil kedua konstruksi filogeni menunjukkan kesamaan t. Laeviceps memiliki kekerabatan yang dekat dengan t. Fuscobalteata dibandingkan t. Chanchamayoensis.