Identifikasi Keragaman Gen Calpastatin (CAST-NcoI) dengan Teknik PCR-RFLP pada Domba Lokal Indonesia

Abstract

Domba lokal di Indonesia memiliki beberapa keunggulan, yaitu mampu bertahan pada iklim tropis, bersifat prolifik, tidak mengenal musim kawin, tahan terhadap beberapa macam penyakit dan parasit. Namun, produktivitas domba lokal masih cukup rendah terutama sifat pertumbuhan dan kualitas daging. Salah satu upaya seleksi dilakukan untuk meningkatkan produktivitas domba lokal yaitu berdasarkan pada penciri DNA yang dikenal dengan Marker Asissted Selection (MAS). Gen calpastatin merupakan gen yang berfungsi menghambat degradasi protein sel-sel otot. Pada mamalia, gen calpastatin diduga memiliki keterkaitan dalam sifat pertumbuhan otot dan keempukan daging. Tujuan dari penelitian ini adalah untuk mengidentifikasi keragaman gen calpastatin pada domba lokal . Sampel DNA yang digunakan dalam penelitian ini berjumlah 232 sampel, yang terdiri dari Domba Ekor Tipis (DET) Jonggol (38), DET Rote (25), domba Garut Ciomas (25), domba Garut Margawati (23), domba Garut Wanaraja (25), Domba Ekor Gemuk (DEG) Indramayu (25), DEG Madura (25), DEG Donggala (25), dan DEG Sumbawa (21). Amplifikasi gen calpastatin dilakukan dengan teknik PCR, sedangkan untuk menentukkan genotipenya dilakukan dengan teknik Restriction Fragment Length Polymorphism (RFLP) menggunakan enzim restriksi NcoI. Analisis data dilakukan dengan menghitung nilai frekuensi alel dan frekuensi genotipe.