Blood Protein Polymorphism Analysis of Pegagan, Alabio, and Mojosari Duckswith Polyacrylamide Gel Electrophoresis (PAGE)Method

Abstract

The objective of this study was to estimate the blood protein polymorphisms of the Albumin, Post Albumin, Transferrin, Post Transferrin-1, and Post Transferrin-2 in Pegagan, Alabio, and Mojosari ducks. This study utilized PAGE method to identify the polymorphism of blood sprotein. Genotyping was performed on 30 samples of ducks blood, which include 10 samples of Pegagan duck, 10 samples of Mojosari duck, and 10 samples of Alabio duck. Genotype and allele frequency, Hardy-Weinberg equilibrium, heterozigosity, genetic distance, and phylogenetic tree were performed in order to describe the polymorphisms of blood protein. The result showed that the averageof heterozygosity in all population was 0.65.The ducks in pegagan duck have a far relathionship with the Mojosari duck and the pegagan duck has a closer relathionship with the Alabio duck. The highest mean allele frequency was found in locus A alelle of post albumin (1.48) and the lowest mean allele frequency was found in B allele of PTf-1 locus. Ducks blood protein polymorphisms were found for Albumin, Post Albumin, Transferrin, Post Transferrin-1 and Post Transferrin-2.

Itik merupakan unggas air yang cukup dikenal masyarakat dan sangat popular dibandingkan unggas air lainnya seperti entog dan angsa. Nenek moyangnya berasal dari Amerika Utara merupakan itik liar (Anas moscha) atau Wild mallard Sampel itik yang digunakan sebanyak 30 sampel yang terdiri dari 10 sampel itik Pegagan, 10 sampel itik Alabio dan 10 sampel itik Mojosari. Identifikasi keragaman genetik protein darah dilakukan menggunakan pendekatan Polyacrylamide Gel Electrophoresis (PAGE) yang diwarnai dengan Coomassie Brilliant Blue (CBB). Data dianalisis dengan menggunakan pendekatan frekuensi genotipe, frekuensi alel, keseimbangan Hardy-Weinberg, heterozigositas, jarak genetik dan pohon filogenik. .Keunggulan ini menjadi potensi ekonomi yang bagus dibandingkan unggas lainnya. Rendahnya produktivitas, kurangnya informasi serta belum adanya pengembangan dan perbaikan mutu genetik menyebabkan pengembangan potensi itik belum optimal. Pendekatan karakterisasi dan potensi genetik perlu dilakukan untuk mempopulerkan dan meningkatkan manfaat itik agar dapat dijadikan sebagai pedoman dalam upaya pembudidayaannya.Sehubungan dengan perbaikan mutu genetik, maka perlu diketahui keragaman genetik dari itik. Identifikasi keragaman genetik dalam suatu populasi digunakan untuk mengetahui dan melestarikan bangsa-bangsa dalam populasi. Salah satu indikator yang menentukan tingkat keragaman genetik adalah protein darah. Penelitian ini bertujuanuntuk mempelajari keragaman genetik protein darah pada lokus Alb, PAlb, Tf, PTf-1 dan PTf-2 pada itik Pegagan, Mojosari dan Alabio dan untuk mengetahui jarak genetik dari ketiga itik tersebut.