Studi hubungan struktur dan aktivasi inhibisi flavonoid terhadap enzim protein tirosin kinase menggunakan prediktor koordinat kartesius kerangka diaril propan

Abstract

Telah dikaji Hubungan Kuantitatif Struktur-Aktivitas (HKSA) pada 105 turunan senyawa flavonoid sebagai penghambat enzim protein tirosin kinase menggunakan data koordinat kartesius atom dalam ruang 3 dimensi hasil perhitungan mekanika kuantum semiempirik Austin Model 1. Orbital medan konsisten diri digunakan untuk membuat hampiran persamaan Schrodinger. Fungsi Energi Potensial Permukaan (EPP) kemudian diiterasi dengan gradien menuju nilai minimum global untuk mencapai optimasi konformasi stereokimia. Kajian telah dilakukan untuk menguji seberapa besar koordinat kartesius atom tersebut dapat dipakai sebagai parameter baru dalam kajian HKSA. Metode pembuktian yang ditempuh adalah teknik kemometri untuk pembentukan model persamaan regresi mulai dari metode MLR (Multl Linear Regression), PCR (Principal Component Regression), PLS (Partial Least Square), sampai gabungan PLS-lapisan Kohonen yang membagi training test menjadi 6 model. Persamaan regresi yang paling dapat diterima adalah model D yang diperoleh dari metode gabungan PLS-lapisan Kohonen dengan nilai R-Sq, R-Sq (pred), dan PRESS (Predicted of Error Sum Square) berturut-turut adalah 54.52%, 36.94%, dan 17.68.