Identifikasi Genotip Menggunakan Marker Mikrosatelit dan Hubungannya dengan Sifat Kuantitatif pada Sapi

Abstract

Penelitian ini dilakukan untuk mengetahui sejauh mana perubahan genetik yang terjadi dari masing-masing lokus mikrosatelit (jumlah, jenis dan frekuensi alel) pada persilangan sapi Bali dengan sapi Brangus dan hubungan antara marker mikrosatelit tersebut dengan sifat kuantitatif seperti berat lahir dan pertambahan berat badan harian ternak. Disamping itu, dalam penelitian ini dilakukan pengujian terhadap stabilitas dan pola segregasi alel spesifik (breed spesific allele) yang akan digunakan sebagai marker molekuler pada sapi Bali. Marker mikrosatelit juga diaplikasikan untuk identifikasi dan verifikasi pejantan dalam struktur reference family. Penelitian ini dilakukan dilakukan di Laboratorium Biak Sel dan Jaringan Pusat Penelitian dan Pengembangan Bioteknologi - LIPI Cibinong. Jangka waktu penelitian adalah satu tahun (Maret 1999 sampai dengan Maret 2000). Sampel DNA yang merupakan materi utama dalam penelitian ini diekstraksi dari sel darah 4 ekor pejantan sapi Brangus, 20 ekor induk sapi Bali dan 20 ekor keturunannya. Enam belas lokus mikrosatelit diamplifikasi menggunakan, PCR kemudian produk yang dihasilkan dideteksi menggunakan Vertikal PAGE dengan pewarnaan perak (silver staining).