Genetic differentiation among populations of Chromobotia macracanthus Bleeker from Sumatra and Kalimantan based on sequencing gene of MtDNA Cytochrome b and Nucleus DNA RAG2

Abstract

Penelitian mengenai diferensiasi genetik beberapa populasi Chromobotia macracanthus Bleeker dari Sumatera dan Kalirnantan berdasarkan sekuensing gen miDNA Cytochrome b dan nukleus DNA RAG2 telah selesai dilaksanakan. Tujuan dari studi ini adalah untuk mendapatkan gambaran diferensiasi genetik antara beberapa populasi ikan botia (Chromobotia macracanthus Bleeker) dari Sumatera dan Kalimantan serta untuk menghitung waktu pemisahan dari kedua grup populasi ikan botia. Sampel populasi ikan botia diambil dari 3 sungai di Sumatera yaitu Batanghari, Musi, dan Tulang Bawang serta dari satu sungai di Kalimantaan yaitu Kapuas. Analisa genetik berdasarkan pada sequencing gen mtDNA Cytochrome b dan nukleus DNA RAG2 Analisa statistik dilakukan menggunakan paket APE pada pemrograrnan bahasa R. Parameter yang diarnati antara lain: keragaman nukleotida, jarak genetik, dan pohon. neighbor-joining.