Karakteristik molekuler Bovine Herpesvirus type 1 isolat Indonesia

Abstract

Perbedaan subtipe bovine herpesvims I (BHV-1) seringkali dihubungkan dengan adanya gejala klinis yang ditimbulkan oleh penyakit tersebut pada ternak sapi. Dalam hal ini perbedaan subtipe akan menjadi penting manakala diperlukan dalam kajian patogenesis dan epidemiologis infeksi BHV-1. Telah berhasil dibedakan antara gen glikoprotein D (gD) BHV-1. I dan BHV-1.2 setelah melalui proses arnplifikasi dan sekuensing terhadap 8 isolat BHV-1 asal Indonesia. Hasil pensejajaran terhadap urutan asam amino menunjukkan bahwa kesamaan genome antar BHV-1 isolat Indonesia mencapai 98,8 hingga 100%. dan ini sama dengan persentase kesamaan asam amino antar BHV-1 isolat Indonesia dengan BHV-1.1 rujukan. Sementara itu; untuk BHV-1 isolat Indonesia dengan BHV-1.2 rujukan memiliki persamaan asam amino antara 98,4 hingga 98,8%. Selanjutnya, isolat-isolat tersebut dapat dikelompokkan ke dalam BHV-1.1 dan BHV-1.2 setelah dilakukan analisis phylogenetic. Hasil analisis philogenetic menunjukkan bahwa semua BHV-1 isolat Indonesia termasuk ke dalam kelompok BHV-1.1 yang merupakan agen infeksi saluran pemafasan pada sapi atau biasa dikenal sebagai penyakit infectious bovine rhinotracheitis (IBR). Hasil diharapkan dapat dijadikan dalam kajian epidemiologi molekuler untuk kelompok herpesvirus.