Restriction Fragment Length Polymorphism (RFLP) Gen Sitokrom B Dna Mitokondria Dari Delapan Spesies Burung

Abstract

Penelitianinibertujuanuntuk mempelajari RestrictionFragmentLength Polymorphism (RFLP) delapanspesiesburunglokalberdasarkanfragmen Sitokrom b DNAmitokondria.Hasilyangdiperolehdapatdigunakansebagai dasarinformasiuntukmengenalispesiesburung.Delapansampeljaringanburung diperolehdisekitarBogordandisimpandalamlarutan NaCl4,5Myang mengandungDMSO25 %.DNAdiisolasidenganmetodepresipitasiamonium asetat.Primeruniversal SitokrombL14841/H15149 digunakanuntukamplifikasi fragmengen sitokrom b DNAmitokondriadenganmenggunakanmetode PolymeraseChainReaction (PCR) yangdilanjutkandenganelektroforesis.DNA hasilPCR(amplikon)kemudian dicerna (dipotong) denganmenggunakanenzim restriksiendonuklease Hinf I(2,5unit)dan Rsa I (20unit) masing-masing selama 2jamdan6jam.PenghitunganukuranDNA amplikon danfragmenhasil pemotongan dilakukandenganmengukurjarakantaramigrasiDNAsampel denganmigrasi DNAladder dalamgelagarose2%.Hasilpenelitianmenunjukkan bahwadelapanspesiesburunglokalmempunyaiamplikonyangberukuran 359pb,sertamempunyaiukuranfragmenrestriksi HinfI yangberbedakecuali bondolpekingdanmanyarjambul.Fragmenrestriksi Rsa I yangdihasilkanjuga berbedakecualimanyarjambuldandederukjawa,sertaayamkampungdan merbahcerukcuk.Berdasarkanhasilpenelitianinidapatdisimpulkanbahwa metodePCRmenggunakanprimeruniversalsitokrombsertapemotongan fragmendenganenzim restriksi HinfI dan atau Rsa I dapatdigunakanuntuk mengenali kedelapan spesiesburung. Katakunci: sitokromb, DNA mitokondria, HinfI, RsaI,burung