Pengembangan Aplikasi T-RFLP Untuk Pencarian Nama Bakteri

Abstract

Salah satu kajian yang banyak diteliti didalam bioinfo:matika adalah menganaJisis keragaman komunitas mikroba. Salah satu metode yang digunakan adalah TRFLP (Terminal Restriction Fragment Polymorphism). Dengan metode ini peneliti akan dapat mengetahui identitas hakleri yang belum diketahui, maka gen 168 rRNA dari bakleri tersebut diambil dan dipotong dengan ellzym restriksi. Panjang potongan tersebut (T-RF) akan dibandingkan dengan panjang T-RF sekuen gen 16S rRNA dari bakteri yang sudah ada di database. Jika hanya menggunakan salu enzym restriksi maka akan terdapat banyak kemungkinan nama bakteri yang muneul, oleh sebab itu malcin sedikit enzym restriksi yang digunakan. maka makin sedikit nama bakteri yang muncuk sehingga nama bakteri yang ditemukan menjadi lebih pasti.