Analisa Single Nucleotide Polymorphism (SNP) pada Aksesi Sengon (Falcataria falcata) Jawa Timur, Toleran terhadap Karat Puru

Abstract

Sengon (Falcataria falcata) tergolong jenis pionir yang cepat tumbuh dan berpotensi diberbagai sektor, namun rentan terhadap penyakit karat puru yang disebabkan oleh Uromycladium falcatarium. Penelitian ini bertujuan untuk mengevaluasi intensitas dan tingkat keparahan serangan penyakit karat puru pada beberapa pohon induk sengon di Jawa Timur dan menentukan genotipenya berdasarkan marka SNP. Evaluasi serangan dilakukan dengan menilai persentase serangan penyakit dilapang. DNA diekstraksi dari sampel 52 pohon sengon dengan 26 aksesi sengon toleran dan rentan. SNP dideteksi dengan teknik HRM. Analisis data serangan dilakukan menggunakan Uji Mann-Whitney, sedangkan data SNP di uji dengan Chi-Square dan divisualisasikan pada Manhattan plot. Hasil penelitian menunjukkan bahwa aksesi toleran secara signifikan memiliki rata-rata serangan lebih rendah dibandingkan aksesi rentan. Analisis HRM mengidentifikasi variasi alel, gen IAA, NUOR, dan WRKY menunjukkan asosiasi terhadap sifat toleransi. Analisis molekuler menggunakan marka SNP dengan metode HRM berhasil mengidentifikasi perbedaan pola genetik antara sengon toleran dan rentan.