Karakterisasi Genom Mitokondria Gen Cyt b pada Ikan Belida Anggota Famili Notoptridae

Abstract

Ikan belida merupakan ikan air tawar, famili Notopteridae yang tersebar di India, Pakistan, Bangladesh, Srilanka, Nepal, Thailand dan Indonesia. Ikan ini sangat populer untuk konsumsi dan sebagai ikan hias. Studi ikan air tawar memiliki aspek penting dalam biogeografi, karena persebarannya di laut yang tidak mudah dan garis evolusinya berkaitan dengan sejarah geologis. Penelitian ini bertujuan untuk mengkarakterisasi runutan nukleotida mtDNA gen cyt b ikan belida anggota famili Notopteridae di sungai Kampar sebagai dasar mempelajari populasi dan posisi filogenetiknya. Sebanyak 12 sampel darah ikan belida diambil pada lima titik berbeda, tiga sampel dari sungai Kampar kanan-Waduk Kuto Panjang (WD), satu sampel dari Sungai Teso (ST), tiga sampel dari Langgam (GG), dua sampel dari Kuala Tolam (KT) dan tiga sampel dari Rantau Baru (RB). Amplifikasi gen cyt b berhasil pada tujuh sampel (WD23, WD24, RB08, RB09, RB11, GG04 dan GG06). Analisis filogeni dilakukan menggunakan metode Kimura-2-parameter berdasarkan dua basa pertama setiap kodon serta asam amino dari seluruh sampel dan spesies pembanding famili Notopteridae dari Genebank. Topografi keduanya menunjukkan bahwa seluruh sampel dan Chitala lopis berada pada kelompok yang sama. Jarak evolusi pada sampel WD 23 lebih besar dibandingkan sampel lainnya. Berdasarkan rasio ts/tv antar sampel dengan spesies pembanding, jenis mutasi substitusi transisi lebih sering terjadi. Keragaman paling tinggi terdapat di Waduk Kuto Panjang. Kekerabatan interpopulasi yang terdekat ialah antara Langgam dengan Rantau Baru sedangkan kekerabatan intrapopulasi yang paling erat terdapat pada populasi Rantau Baru.