Keragaman Genetik Sapi Peranakan Ongole (Po) Berdasarkan Uji DNA Mikrosatelit

Abstract

Pada saat ini DNA mikrosateIit banyak digunakan sebagai marker untuk mempelajari variasi genetik. DNA mikrosateIit merupakan rangkaian molekul DNA pendek yang susunan basanya berulang dan terdapat melimpah dalam genom eukariot. Dalam penelitian ini, enam lokus mikrosateIit digunakan untuk menetapkan tingkat variabilitas genetik dalam populasi sapi PO. Nilai heterozigositas (Ii), heterozigositas rataan (fl), dan variasi genetik populasi dihitung dan dibandingkan. Penghitungan perbedaan antar subpopulasi dan jarak genetik dilakukan untuk mengetahui derajat diferensiasi dalam subpopulasi. Selanjutnya, indeks fiksasi juga dilakukan untuk mengetahui pola kawin populasi atau pola selekainya dihubungkan dengan aiel polimorfik. Hasil penelitian menunjukkan bahwa sapi PO mempunyai variasi genotipe dan heterozigositas yang tinggi. Heterozigositas rataan pada empat subpopulasi berkisar 0,505-0,606. DNA mikrosatelit populasi sapi PO bersifut polimorfik. Dalam populasi tersebut, terjadi diferensiasi genetik (Gsr 37,1%), karena tidak terjadi kawin silang antar subpopulasi (Fsr 0,3841) dan jarak genetik berkisar 0,242-0,767.