Analisis Promotor Gen B11 Padi (Oryza sativa L.) cv. Hawara Bunar dan IR64
View/ Open
Date
2015Author
Fendiyanto, Miftahul Huda
Miftahudin
Chikmawati, Tatik
Metadata
Show full item recordAbstract
Sifat toleransi tanaman terhadap cekaman Al dikendalikan secara genetik.
Gen B11 yang merupakan kandidat gen toleransi terhadap cekaman Al berhasil
diisolasi dari padi cv. Hawara Bunar. Gen B11 mengalami tingkat ekspresi pada
cv. Hawara Bunar lebih tinggi dibanding ekspresi gen tersebut pada cv. IR64.
Perbedaan ekspresi tersebut kemungkinan terjadi karena perbedaan sekuen
promotor. Penelitian ini bertujuan menganalisis perbedaan sekuen promotor gen
B11 pada padi cv. Hawara Bunar dan IR64, serta mengklon promotor ke vektor
ekspresi pMDC107 yang membawa gen reporter green fluorescence protein
(GFP). Metode penelitian ini meliputi analisis bioinformatika dari sekuen
promotor, kloning promotor ke pMDC107, transformasi ke E.coli TOP10 dengan
pMDC107 rekombinan, serta verifikasi sisipan promotor pada pMDC107
rekombinan. Hasil penelitian menunjukkan bahwa promotor B11 telah berhasil
diklon ke dalam vektor pMDC107. Sekuen promotor gen B11 dari padi cv.
Hawara Bunar berbeda pada 15 single nucleotide polimorphisms (SNPs) dengan
sekuen promotor gen B11 dari cv. IR64. Promotor gen B11 dari cv. Hawara Bunar
memiliki lebih banyak motif yang berkaitan dengan cekaman abiotik dan patogen
dibandingkan dengan promotor gen B11 dari cv. IR64. Perbedaan sekuen
promotor tersebut berkaitan dengan perbedaan ekspresi gen B11 pada kedua
kultivar tersebut.
Collections
- UT - Biology [2144]